1、強磁磁選機選礦的工藝對象是弱磁性礦物，在我國主要是選別赤鐵礦，我國的赤鐵礦品位低、嵌布粒度細，磨礦過程是很難使赤鐵礦與脈石全部單體解離，總存在大量的連生體顆粒。在強磁場磁選中，連生體的大多數會被回收進入磁性產品中，降低了精礦品位，如果降低磁場強度，勢必造成金屬大量流失，因此強磁選作業一般都不能兼顧精礦品位和回收率，這樣，強磁選機就很難作為一個獨立的選別工藝，而是要有其他選礦方法相配合。一般來說，強磁選作業用作拋尾脫泥，具有其他工藝不能比擬的優點，獲得的強磁精礦需用重選或浮選方法進行再選，才能達到市場要求的品位。

2、強磁場磁選設備價格昂貴、投資多、費用高，小規模選廠不宜采用。

3、在進行強磁選之前，如果礦石中含有5%以上的強磁性礦物，必須先經弱磁選把強磁性礦物選出來，否則，強磁性礦物會在強磁磁選機的分選間隙中產生“磁搭橋”造成磁短路或堵塞分選間隙，使強磁選難以進行。

4、強磁場磁選機的分選間隙一般都很小，為防止雜物及大粒礦石堵塞分選間隙，在入選前要對礦漿進行篩分除渣。

5、為滿足強磁磁選機對入選濃度的要求，選前還往往設置濃縮作業。